課程介紹

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本次課程內容主要圍繞以下主題：R語言基礎培訓，數量遺傳學常用模型，育種中常見模型分析（重復力模型分析，窩別效應模型分析，母體效應模型分析，閾值性狀模型分析，環境相關（TypeB相關）等），育種數據分析實戰，全基因組選擇（GS）等。

課程研發背景：
在育種中，如何高效地分析育種數據，準確地進行遺傳評估對育種工作者來說至關重要。對于不同的數據，如何選擇合適的模型，如何進行基因組選擇分析，如何計算育種值和近交系數，如何選種選配等內容都是育種單位迫切需求的知識，通過本次培訓，您可以得到一套完整的解決方案。
ASReml軟件是國際知名的遺傳評估軟件，新版本ASReml-R V4和ASReml-SA更適合大數據的基因組選擇分析，計算效率高，模型豐富，操作簡單，在國際上應用廣泛。

課前要求
因課程包含大量實戰演練，請學員安裝好 R版本，RStudio版本以及ASReml-R 第四版軟件。
為保證學員順利 學習、 及時處理目前數據分析需求及 后期實際應用。

報名后提供如下資料：
1、報名學員，可以在成功報名后10天內，在平臺上直接聯系班主任或助教老師、及時免費獲得ASReml-R 4 版正式授權（3個月左右），過期失效；
2、ASReml 軟件用戶，報名后請直接使用已有軟件進行上課（如享客戶課程優惠則不再另提供軟件）；
3、報名學員均可獲得所有相關案例數據、分析代碼、擴展學習等資料（課程數據等請在最下方下載）；
4、發票： 報名學員如需發票，請務必在成功報名后10天內，及時聯系開具所需發票，過期失效。

你將獲得
學會選擇合適的育種模型及進行基因組選擇；
學會計算育種值和近交系數及選種選配；
獲得3個月左右ASReml軟件使用權限；
技術支持給您解疑答惑。

課程目標

通過系統的理論及案例講解，結合上機實操練習及學員實際問題交流答疑，提升學員工作中數據分析能力；
學習如何利用R語言進行基本數據分析；快速掌握ASReml-R 4在工作中實際應用；
掌握基因組選擇分析，包括表型數據清洗，基因型數據清洗，矩陣構建，異常樣本篩選，模型選擇，GEBV計算，交叉驗證等內容。

課程大綱

01.
R語言培訓（1節）
R語言及R包安裝配置；讀取數據和清洗數據；數據匯總統計和建模分析；R語言作圖實戰
1.R語言基礎培訓 145分鐘

02.數量遺傳學及動物模型（1節）
數量遺傳學基礎；混合線性模型；半同胞全同胞模型；各種動物模型介紹及分析
1.數量遺傳學及動物模型 182分鐘

03.多性狀模型與閾值性狀（1節）
連續和連續性狀模型； 閾值和連續性狀模型；閾值和閾值性狀模型；批量計算遺傳相關和表型相關等
1.多性狀模型與閾值性狀 136分鐘

04.基因組選擇GBLUP等（1節）
基因組選擇：GBLUP，ssgblup，rrblup，貝葉斯模型，交叉驗證及模型評價
1.基因組選擇：GBLUP 193分鐘

05.軟件包下載及安裝（3節）
主要是課程所需的R包，Rstudio包及ASReml 包
1.R包 75.9MB  |  exe文件
2.Rstudio 0.2GB  |  exe文件
3.ASRmel及ASRgenomics 87.2MB  |  rar文件

06.課程涉及的示例數據及代碼（1節）
包括每個章節的示例數據及代碼
1.示例數據集代碼 82.5MB  |  rar文件